En esta ocasión, el agente Naked Snake, en plena Guerra Fría, tendrá que ir en busca del científico Sokolov, secuestrado por los soviéticos, oculto en la jungla. Nosotros, lógicamente, tendremos que atravesar las líneas enemigas, preferiblemente sin ser vistos, hasta llegar a nuestro objetivo. Sin embargo, en esta ocasión, como decíamos, todo cambiará, puesto que los entornos industriales y complejos militares vistos en anteriores capítulos no aparecerán tan pronto como esperábamos. Por lo tanto, uno de nuestros principales enemigos, y también aliados, será el entorno que nos rodeará.
