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La historia de Klonoa 2 nos sumerge de nuevo (tras visitar Klonoa en su anterior aventura el mundo de Phantomile) en un fantástico y extraño mundo, llamado Lunatea. Este mundo está formado por 4 reinos, albergando cada uno de ellos una de las cuatro legendarias campanas de la armonía llamadas respectivamente: la Tranquilidad, el Gozo, la Discordia y la propia Armonía que son necesarias para preservar la paz en Lunatea. Pero hay una quinta campana oculta, la Tristeza, que amenaza con perturbar y alterar el equilibrio en el que se encuentran estos reinos y traer el caos y la oscuridad a este mundo. Sin embargo una profecía conocida desde siempre llegó a vaticinar que en momentos de necesidad vendría un “Viajero de los Sueños” que llevaría consigo un anillo místico y que será la clave para salvar el mundo de Lunatea.